Руководитель – врач высшей категории Елеубаева Жанар Болатовна.

Лаборатория организована в 1960г. основные научные направления посвящены актуальным проблемам цитоморфологической диагностики опухолей и предопухолевых заболеваний, автоматизации цитологических исследований и скринингу ранних форм рака в системе целевых профилактических обследований населения РК. Результаты научных исследований внедрены в практическую деятельность в виде руководств, методических рекомендаций и подготовленных кадров клинических цитологов.

В настоящее время лаборатория цитологии выполняет научные, диагностические, консультативные, методические и учебные программы по клинической цитологии, а также внедряет в практику новые инновационные технологии в республике. Сотрудники лаборатории являются членами Международной, Европейской, Японской и Российской ассоциаций клинических цитологов, проводят совместные научные исследования.

На базе лаборатории проводятся мастер классы по трансферту новых технологий: обучение на проточном цитофлюориметре по определению фенотипа, плоидности ДНК, морфометрии и иммунноцитохимии опухолей, а также – на аппарате жидкостной цитологии с применением и оценкой по современной классификации (Бетезда) предопухолевых и опухолевых процессов методом Пап-теста, совместно с учеными России, Японии, Кореи. На базе лаборатории под руководством профессора Шибановой А.И. подготовлены 17 кандидатов медицинских наук, прошли специализацию по клинической цитологии свыше 300 специалистов, опубликовано более 35 методических рекомендаций, 720 научных статей. В 2011г выпущено руководство (атлас) «Цитологическая диагностика заболеваний пищевода, желудка и кишки», авторами которого являются Н.А. Шапиро, А.И.Шибанова, Ж.Б. Елеубаева.